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近日,中國農(nóng)業(yè)大學(xué)國家生物育種產(chǎn)教融合創(chuàng)新平臺高性能計算機系統(tǒng),經(jīng)過驗收投入使用。該系統(tǒng)由中科曙光依托“超智融合”技術(shù)方案建設(shè),集生物信息分析、大數(shù)據(jù)分析、AI數(shù)據(jù)挖掘、育種模型訓(xùn)練等能力,為生物育種等科研項目等提供算力支撐。


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國家生物育種產(chǎn)教融合創(chuàng)新平臺由國家發(fā)改委和教育部批準(zhǔn)建設(shè)。平臺建設(shè)目標(biāo)是做好科學(xué)研究、人才培養(yǎng)、學(xué)科建設(shè)等協(xié)同攻關(guān),為國家玉米生物育種等關(guān)鍵技術(shù)突破和自主人才培養(yǎng)作出貢獻(xiàn)。


以往,中國農(nóng)業(yè)大學(xué)開展生物育種科研計算時普遍面臨:眾多生物信息學(xué)軟件與計算環(huán)境不適配導(dǎo)致科研效率低;通用與人工智能混合計算場景缺失無法支撐AI for Science研究;存儲與網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)性能不足導(dǎo)致基因測序等難開展;網(wǎng)絡(luò)與計算設(shè)施缺少自動化監(jiān)控與資源調(diào)度能力致使計算資源利用率差等難題。


就上述難題,曙光超智融合方案依托開放、完善的生態(tài)計算架構(gòu),整合通用與AI多元算力,支持基因比對、蛋白質(zhì)模擬等數(shù)十種生物信息學(xué)專業(yè)計算場景,并適配AlphaFold等深度學(xué)習(xí)模型。


曙光自研的計算管理平臺,實現(xiàn)了通用與AI算力的池化統(tǒng)一調(diào)度,在降低多任務(wù)并行運維復(fù)雜度的同時,也避免了算力資源浪費,保障科研與教學(xué)開展效率。


為支撐基因序列實時分析、蛋白質(zhì)測序等高性能計算場景,曙光方案采用全閃存儲和大容量混閃存儲雙系統(tǒng),在提供微秒級數(shù)據(jù)響應(yīng)的同時實現(xiàn)PB級容量存儲,既保障計算節(jié)點快速獲取高頻數(shù)據(jù),又降低長期存儲成本。


面對TB級數(shù)據(jù)毫秒級延遲傳輸需求,曙光網(wǎng)絡(luò)方案通過多重冗余鏈路設(shè)計和智能調(diào)度技術(shù),確保了海量數(shù)據(jù)傳輸零中斷并自動規(guī)避網(wǎng)絡(luò)擁堵,提升計算資源利用率超30%,減少作業(yè)排隊等待時間,并將基因樣本分析中的數(shù)據(jù)傳輸耗時從數(shù)小時壓縮至幾分鐘。


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